Le noeud de Hensen des Oiseaux est considéré comme « l'organisateur » c'est-à-dire le centre fonctionnel de la gastrulation au même titre que la lèvre dorsale du blastopore des Amphibiens, le nœud des Mammifères et le bouclier du Poisson zèbre. Il a été démontré récemment que cette structure contient tous les tissus progéniteurs de la ligne médiane de l'embryon (floor plate, notochorde et endoderme dorsal). Cependant, des expériences portant sur cette structure chez l'embryon de Poulet conduisent à penser que la fonction « organisatrice » doit être attribuée à une zone extrêmement limitée qui constitue la frontière entre les territoires présomptifs du tissu axial et du tissu paraxial. Cette région est essentielle pour le recul du noeud de Hensen et la mise en place progressive des structures axiales et paraxiales.