Le développement extrêmement important de la recherche fondamentale sur les cytokines a été suivi par de nombreuses applications cliniques notamment dans le domaine du cancer et des maladies infectieuses. Les pathologies inflammatoires et auto-immunes sont autant de futures applications. La mise au point et la validation de méthodes sensibles et reproductibles de dosage des cytokines recombinantes dans les milieux biologiques est une étape fondamentale préalable à toute évaluation pharmacologique. Les techniques immunoenzymatiques (ELISA) sont les plus fréquemment utilisées bien qu'elles requièrent une standardisation et qu'elles ne font pas la part des réactions croisées dues aux homologies structurales entre cytokines. Les données pharmacocinétiques doivent être interprétées en tenant compte de nombreux facteurs de variation comme la production de cytokines endogènes, la fixation aux récepteurs fixes ou circulants, la présence d'antagonistes des récepteurs et de récepteurs solubles. En outre, les cytokines recombinantes sont immunogéniques et peuvent générer la synthèse d'anticorps bloquants. Les études de pharmacocinétique sont en général peu informatives et, contrairement aux médicaments classiques, la stratégie du développement clinique devra tout particulièrement reposer sur les données de pharmacodynamie: les concentrations de cytokines activant les récepteurs et le temps d'occupation de ces récepteurs sont utiles pour déterminer le choix de la dose et le rythme des administrations cliniques. Les cytokines recombinantes partagent des activités biologiques, agissent de façon synergique ou antagoniste, de telle sorte que leur évaluation pharmacodynamique est complexe. Il n'existe pas de relation entre la dose et l'activité, et l'utilisation de marqueurs intermédiaires de cette activité est utile pour déterminer la dose biologique optimale (DBO). tel que le dosage de la 2',5'-oligo(A) synthétase ou celui de la néoptérine après l'administration d'interféron. La tolérance clinique des cytokines recombinantes est difficilement prédictible à partir des données expérimentales chez l'animal en raison de la spécificité d'espèce. Il est donc nécessaire de mettre au point des modèles d'animaux transgéniques et des modèles parallèles. Enfin, les cytokines de type pro-inflammatoire sont de puissants inhibiteurs du cytochrome P450 et peuvent être à l'origine d'interactions médicamenteuses.