Le laboratoire de l'hôpital a une importante responsabilité dans la surveillance, le contrôle et la prévention des infections nosocomiales. La contamination de l'environnement (eau, air, surfaces) peut être à l'origine de ces infections. Ainsi, il est important de développer un système de surveillance de la contamination de l'environnement lorsque celui-ci est maîtrisé. Préalablement, il faut définir et classer les zones en fonction des risques (faible, modéré, haut et très haut risque) en accord avec les guides ou les recommandations quand ceux-ci existent. Des niveaux de biocontamination acceptables doivent ensuite être attribués à chaque zone à risque. Le manque de corrélation entre les valeurs mesurées de biocontamination et les taux d'infections cliniques rend difficile l'existence d'une réglementation des taux de contamination microbienne de l'environnement.