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Identification d’espèce et épidémiologie moléculaire des bactéries du genre Ochrobactrum

Auteurs : Teyssier C1, Jumas-Bilak E1, Marchandin H2, Jean-Pierre H2, Jeannot JL1, Dusart G1, Foulongne V1, Siméon de Buochberg M1
Affiliations : 1Laboratoire de bactériologie, faculté de pharmacie, 15, avenue Charles-Flahault, 34093 Montpellier cedex 5, France2Laboratoire de bactériologie, hôpital Arnaud-de-Villeneuve, 371, avenue du Doyen-Gaston-Giraud, 34295 Montpellier cedex 5, France
Date 2003 Février, Vol 51, Num 1, pp 5-12Revue : Pathologie-biologieType de publication : article de périodique; DOI : 10.1016/S0369-8114(02)00361-9
Article original
Résumé

Le genreOchrobactrumcomporte deux espèces d’intérêt médical,Ochrobactrum anthropietOchrobactrum intermedium. Ce sont des bactéries de l’environnement de plus en plus fréquemment isolées en clinique humaine en particulier chez des patients immunodéprimés et lors d’infections nosocomiales. Les critères phénotypiques d’identification d’espèce sont mal définis, ce qui conduit à une mauvaise évaluation du rôle de chaque espèce en clinique. Par séquençage de l’ADN ribosomal 16S, nous avons identifié au niveau de l’espèce 20 isolats cliniques d’Ochrobactrumsp. Nous avons alors étudié les caractères phénotypiques de chaque isolat, en particulier la morphologie, la culture sur divers milieux et dans diverses conditions de température, les caractères biochimiques et le profil de résistance aux antibiotiques. L’aspect des colonies sur milieux Trypticase-Soja et McConkey, la culture à 45 °C sur milieu Trypticase-Soja, la présence d’une uréase, la résistance à la nétilmicine, la tobramycine et la colistine permettent de différencier les espèces. Le ribotypage par les endonucléasesHindIII etEcoRI donne un critère de plus pour l’affiliation à une espèce mais ne permet pas un suivi épidémiologique. Par contre, l’électrophorèse en champ pulsé met en évidence un fort polymorphisme entre souches de la même espèce et détecte les souches clonales. Cette technique est donc un outil performant pour des études d’épidémiologie moléculaire sur les bactéries du genreOchrobactrum.

Mot-clés auteurs
ADNr 16S; ECP; PCR; Phénotype; Ribotypage;
 Source : Elsevier-Masson
 Source : MEDLINE©/Pubmed© U.S National Library of Medicine
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Teyssier C, Jumas-Bilak E, Marchandin H, Jean-Pierre H, Jeannot JL, Dusart G, Foulongne V, Siméon de Buochberg M. Identification d’espèce et épidémiologie moléculaire des bactéries du genre Ochrobactrum. Pathologie-biologie. 2003 Fév;51(1):5-12.
Courriel(Nous ne répondons pas aux questions de santé personnelles).
Dernière date de mise à jour : 27/11/2015.


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