Les déformations et malformations mandibulaires sont nombreuses et diverses. Leur diagnostic est habituellement clinique, mais l'imagerie est utile pour les décisions chirurgicales. La TDM est indispensable pour l'étude des dystrophies telles la dysplasie fibreuse, la neurofibromatose, la naevomatose basocellulaire et le chérubisme. Certains troubles de la croissance aboutissent à un aspect pseudo-malformatif. Les séquelles des fractures condyliennes et l'ankylose, mais aussi l'hypoplasie mandibulaire unilatérale par malformation capillaro-veineuse nécessitent un bilan TDM ou IRM. D'autres troubles de la croissance tels les problèmes orthognatiques, l'hypercondylie, et certaines malformations telles les fentes latérales de la face sont de diagnostic clinique ; la TDM-3D n'y sert que de document d'appoint. Pour les syndromes de Romberg et de Pierre Robin, l'IRM est utile pour l'analyse des parties molles.