Cette étude évalue la prévalence et la densité parasitaire des hémoparasites chez 440 chauves-souris appui-tenant à 14 espèces, et collectées sur 5 sites répartis dans différents milieux bioclimatiques de Madagascar. 93 (21%) chauves-souris se sont révélées positives à l'examen microscopique d'un frottis sanguin, avec par ordre de fréquence Haemoproteidae (15,7% des 440 chauves-souris), microfilaires (7,0%) et Trypanosoma (0,7%). Ces 93 chauves-souris appartiennent à seulement 4 espèces; et 92 d'entre elles (99%) appartiennent à la famille des Vespertilionidae. Ces quatre espèces présentant des parasites sont endémiques de la région malgache : Miniopterus manavi pour Haemoproteidae (38% des 129 individus), microfilaires (23%) et Trypanosoma (2%); Myolis goudoti pour Haemoproteidae (24% des 68 individus) et microfilaires (1%); Miniopterus gleni pour Haemoproteidae (23% des 13 individus); et Triaenops furculus pour Haemoproteidae (4% des 28 individus). Le portage parasitaire n'est pas lié au sexe des chauves-souris. Chez Miniopterus manavi, les individus les plus lourds ont une prévalence de microfilaires nettement supérieure; et parmi les individus parasités, les plus lourds sont ceux qui ont la plus forte charge microfilarienne. Dix espèces de chauve-souris (avec 202 individus examinés) se sont révélées négatives à l'examen microscopique des hémoparasites. Cette étude est la première à mettre en évidence des hémoparasites chez les chauves-souris malgaches; elle soulève nombre de questions relatives à la distribution de ces parasites par espèces et familles de chauve-souris, à leur pathogénicité, et à leur mode de transmission vectorielle.