Les infections à Chlamydia posent des problèmes de santé publique par leur fréquence et leurs complications. Volontiers asymptomatiques, les infections génitales à Chlamydia trachomatis passent à la chronicité de manière insidieuse et sont responsables de stérilité et de grossesse extra-utérine. Les infections respiratoires à Chlamydia pneumoniae touchent le jeune enfant et leur responsabilité dans le déclenchement de la crise d'asthme et l'athérosclérose est envisagée. Les caractéristiques de ces infections sont dues à des mécanismes physiopathologiques faisant intervenir notamment, différentes formes de la bactérie. L'existence de formes bactériennes non cultivables et antigéniquement modifiées pose des problèmes de diagnostic et de traitement. Seules les techniques utilisant l'amplification génique sont capables de détecter la bactérie sous toutes ses formes. Si le traitement antibiotique des infections aiguës non compliquées à Chlamydia est bien codifié et efficace, celui des infections chroniques persistantes reste à définir.