L'infection et l'inflammation du tractus génital masculin ont été reconnues responsables de, ou liées à l'infertilité dans des pourcentages variant de 8 à 35 % selon les auteurs. Leur investigation fait partie du bilan d'infertilité ou de pathologies andrologiques dans un processus multidisciplinaire où se font jour des techniques récentes comme la recherche de l'intégrité de l'ADN. L'infection du sperme peut causer une inflammation passagère ou chronique persistante. La bactériospermie, la leucospermie, les IgA sécrétoires anti-Chlamydiaet les cytokines inflammatoires aident à approcher la responsabilité de l'inflammation dans l'infertilité ou la pathologie étudiée, conduisant à un traitement antibiotique et anti-inflammatoire. Dans l'Assistance médicale à la procréation (AMP), la bactériospermie doit être éradiquée en vue de l'innocuité de la préparation à inséminer ou de la fécondation in vitro (FIV). Les leucocytes ne peuvent pas être totalement éliminés par la migration en gradient de concentration et l'utilisation d'antibiotiques et d'antioxydants dans le mileu de culture a été proposée.