Les probiotiques sont des bactéries ou des levures qui modulent la prolifération bactérienne de l'intestin. Les plus répandus sont le Lactobacillus et le Saccharomyces cerevisiae. Ils sont largement utilisés comme compléments alimentaires et comme médicaments dans le traitement et la prophylaxie des diarrhées. Ce traitement est normalement considéré comme sûr, toutefois plusieurs cas d'infections invasives ont été rapportés dans certaines populations. Cet article passe en revue la littérature disponible sur ce sujet et discute des indications et des risques, liés à la prescription de ces molécules, notamment chez les patients immunosupprimés.