Objectifs. Décrire l'épidémiologie bactérienne des infections du site opératoire (ISO) et leur profil de sensibilité, pour une optimisation de l'antibiothérapie probabiliste. Matériels et méthodes. Etude rétrospective transversale menée sur 6 mois au service du laboratoire du CHU de Bobo-Dioulasso du 1er novembre 2006 au 30 avril 2007. Tous les prélèvements positifs de pus réalisés pour le diagnostic étiologique d'infection du site opératoire (ISO) ont été inclus. Résultats. Nous avons colligé 159 cas d'ISO sur 681 patients opérés et hospitalisés soit un taux d'incidence de 23,35 %. Au total, 112 patients ont bénéficié d'un prélèvement en vue d'un diagnostic étiologique. L'analyse des 112 prélèvements a donné lieu à l'identification de 103 souches bactériennes. Les entérobactéries représentaient 54,0 %, les cocci à Gram positif 29,0 % et les bacilles à Gram négatifs non fermentaires 16,5 %. Escherichia coli était l'espèce prédominante dans notre série (30,0 %) suivie de Staphylococcus aureus (16,5 %) et Pseudomonas aeruginosa (12,0 %). La résistance des isolats d'entérobactéries était de 71 % pour l'amoxicilline, 64 % pour l'association amoxicilline-acide clavulanique et 15 % pour les céphalosporines de troisième génération. S. aureus était sensible à la meticilline à 85 %. La résistance des bacilles à Gram-négatif non fermentaires était de 68,8 % pour les carboxypénicillines et 56,0 % pour les fluoroquinolones. Conclusion. Nos résultats suggèrent la possibilité de traiter les ISO par l'association C3G-aminosides avec un relais oral par les fluoroquinolones.