Depuis septembre 2002, la Côte d'Ivoire, est confrontée à un conflit armé qui a entraîné la partition du pays en deux. Dans la partie sous contrôle gouvernemental, la continuité des soins de santé était assurée. Dans celle sous contrôle des Forces Nouvelles, les couvertures sanitaires ont considérablement chuté suite à la fermeture des établissements sanitaires, due au départ des agents de santé qualifiés. Dans cette étude transversale à visée descriptive, nous avons voulu quantifier l'impact de cette crise sur le système de Santé du district sanitaire de Séguéla qui fait partie des districts affectés par la guerre. Les résultats suivants ont été observés, 60,7% des établissements sanitaires du district ne sont plus fonctionnels, 77,7% des agents qualifiés ont abandonné leur poste de travail, 46,2 % des structures sanitaires ont été détériorées. Certains hôpitaux de référence et établissements sanitaires ont fonctionné grâce au soutien des organismes humanitaires. Cependant, les couvertures sanitaires ont connu une baisse conséquente entraînant une recrudescence de rougeoles et des IST. De plus, les gastrites et la traumatologie sont apparues dans les 10 premières causes de morbidité. Pour la relance effective des activités dans le district sanitaire de Séguéla, le retour des agents de santé, la réhabilitation et le rééquipement des établissements sanitaires s'avèrent indispensables.