Le Ministère de la Santé du Bénin a recommandé l'utilisation de la combinaison artéméther―luméfantrine pour le traitement du paludisme simple depuis 2004. Pour pallier ces problèmes d'observance, nous nous sommes intéressés à la combinaison artémisinine―naphthoquine (Arco^®) qui s'administre en une seule prise. La présente étude a pour objectif d'évaluer et de comparer l'efficacité et la tolérance de la combinaison fixe artémisinine―naphthoquine versus la molécule de référence artéméther―luméfantrine (Coartem^®) administrée en deux prises pendant trois jours dans le traitement du paludisme simple chez les enfants au Bénin. Un essai clinique, comparatif randomisé en simple insu, a été réalisé de juillet à octobre 2008 et de mai à septembre 2009 à l'hôpital La Croix de Zinvié. Les patients étaient suivis pendant 28 jours dans les deux bras. Une goutte épaisse et un bilan biologique ont été réalisés au début et au cours du suivi. La PCR a été utilisée pour distinguer les recrudescences des réinfestations. Le principal critère de jugement pour l'efficacité était le taux de guérison à j3, j7, j14, j21, j28. Les autres critères étaient le temps de clairance thermique et le temps de clairance parasitaire. Le critère pour la tolérance était l'incidence des effets indésirables cliniques et biologiques posttraitement. Cent soixante-quatorze enfants âgés de six mois à 15 ans, dont 84 dans le bras Arco^® et 90 dans le bras Coartem^®, ont été inclus dans l'étude. Le taux de guérison était respectivement de 98,8 % pour Arco^® et de 100 % pour Coartem^® à j28 sans différence statistiquement significative. La clairance thermique est obtenue en 24 heures dans les deux groupes. La clairance parasitaire quant à elle est obtenue en 48 heures pour le groupe Arco^® et en 60 heures pour le groupe Coartem^®. Les deux traitements étaient bien tolérés sans effets indésirables majeurs. Cette étude permet donc de conclure que la combinaison artémisinine―naphthoquine est aussi efficace et aussi bien tolérée que la combinaison artéméther―luméfantrine dans le traitement du paludisme simple chez les enfants au Bénin. Ce médicament administré en prise unique constitue ainsi une thérapie de choix permettant de réduire les problèmes d'observance lors des traitements de longue durée et aussi de faciliter la prise en charge communautaire.