L’exercice est une situation qui met en jeu simultanément les réponses cardio-circulatoires, respiratoires et métaboliques. En conséquence, l’interprétation clinique des résultats de l’exploration fonctionnelle à l’exercice incrémentale (EFXi) nécessite d’avoir une connaissance intégrée de la physiologie et la physiopathologie de l’exercice. Le but de cet article est de proposer une méthode systématique pour aider le clinicien à organiser un raisonnement physiopathologique à partir des grandeurs mesurées au cours de l’exercice incrémental. Nous proposons une évolution de la méthode d’interprétation exposée en 1998 en distinguant quatre étapes intitulées : analyse descriptive, hiérarchisation des désordres, propositions mécanistiques et décision diagnostique et/ou thérapeutique. L’analyse descriptive répond à sept questions physiologiques ; la hiérarchisation se base sur l’ampleur des désordres observés et leur pertinence par rapport à la plainte ; face à un désordre on émettra plusieurs propositions mécanistiques et on proposera des étiologiques compatibles avec l’ampleur des anomalies fonctionnelles ; enfin on confirmera ces hypothèses par des explorations spécifiques ou une recommandation thérapeutique.