La maladie de Whipple est une maladie bactérienne multisystémique caractérisée par une malabsorption, des diarrhées et des polyarthralgies. Les manifestations oculaires sont réprésentées par des uvéites, hyalites, rétinites, vascularites, myosites, œdèmes papillaires et atrophies optiques. Nous rapportons le cas d'un patient de 63 ans porteur d'une maladie de Whipple présentant une panuvéite bilatérale sévère; les manifestations ophtalmologiques sont survenues tardivement, 30 ans, par rapport à la maladie initiale et il n'existait alors plus de signes digestifs ni articulaires. Une vitrectomie diagnostique et thérapeutique a été réalisée pour chaque œil. Les prélèvements vitréens ont été étudiés en PCR (Polymerase Chain Reaction) selon une méthode originale décrite récemment; ceci a permis de mettre en évidence l'ARN 16S correspondant au Trophyrema Whippelii alors que l'histologie ne retrouvait des macrophages PAS positifs que dans un seul des prélèvements. Cette nouvelle stratégie diagnostique par PCR semble spécifique et plus sensible que le diagnostic histologique.