La forte association existant entre HLA-B27 et les spondylarthropathies demeure toujours inexpliquée. Douze sous-types de la molécule, B^*2701 à B^*2712, ont été décrits dans différentes populations et seraient différemment associés à la maladie. Cette différence d'association serait le résultat d'une différence dans la présentation des peptides endogènes. Cette hypothèse a été évaluée sur le plan des motifs peptidiques de liaison de la molécule à partir des peptides endogènes extraits de ces différents allèles. Les résultats ont montré qu'un motif peptidique avec une tyrosine en position C-terminale n'est pas une caractéristique des sous-types de susceptibilité à la maladie comme cela a été évoqué, car B^*2707 fait exception à cette règle. Une différence peut néanmoins exister au niveau individuel entre les peptides endogènes présentés par les sous-types associés et ceux non associés à la maladie.