ObjectifPrésenter une plateforme bio-informatique permettant le développement de méthode et la quantification de molécules d’intérêts toxicologiques (drogues et médicaments).MéthodeLa quantification de petites molécules est devenue essentielle dans les sciences du vivant ainsi qu’en toxicologie. La quantification par LC-MS s’effectue préférentiellement sur des spectromètres de masse de type triple quadripôle. Le mode d’acquisition « selected reaction monitoring » (SRM ou MRM) est le mode privilégié pour la quantification. Généralement l’optimisation des transitions se fait en utilisant des solutions standards pour chaque composé à analyser. XCMS-MRM et METLIN-MRM, propose un moyen informatique en ligne et en libre accès, constitué d’une base de données de transitions MRM et d’un logiciel de quantification. La librairie de transitions MRM (METLIN-MRM) a été construite en utilisant des transitions optimisées de façon expérimentalement (traditionnelle), des transitions optimisées de façon computationnel et enfin des transitions issues de la littérature. La plateforme de quantification en ligne (XCMS-MRM) quant à elle est compatible avec les données brutes issues de n’importe quelle marque d’instrument. Elle permet ainsi l’intégration automatique, l’établissement des droites de calibrations, la détermination de la LOD et LOQ, l’évaluation des QCs et aussi l’analyse statistique des données. Ces outils sont directement utilisables sur internet et ne nécessitent pas le téléchargement de logiciels. Les données sont stockées sur un serveur “cloud” pour être traitées.RésultatsL’évaluation des transitions établies de façon computationnelles a été faite en les comparant avec les transitions optimisées de façon expérimentalement pour 641 molécules, (métabolites endogènes, drogues, médicaments, …). Dans 90 % des cas, les molécules partageaient au moins une transition commune. Et dans 62 % des cas, les molécules partageaient au moins une transition commune et avaient une énergie de collision identique. L’évaluation des performances de la plateforme de quantification a été faite en comparant les résultats obtenus en utilisant les logiciel Analyst® ou Multiquant® (logiciels de fabricant) à ceux obtenus avec XCMS-MRM. Les résultats d’analyses quantitatives du THC et de la cocaïne, ainsi que leurs métabolites respectifs, ont été comparés pour 354 échantillons sanguins. Pour la cocaïne et ses métabolites l’erreur relative entre les deux méthodes était inférieur à 15 % et pour le THC et ses métabolites, l’erreur relative était inférieure à 20 %[1].ConclusionXCMS-MRM et METLIN-MRM proposent une plateforme informatique libre accès pour le développement de méthode et la quantification par LC-MRM/MS. La base de données regroupe plus de 23 000 transitions et l’interface de quantification, simple à utiliser et convivial, est compatible avec les données d’issues des différents constructeurs de spectromètre de masse.