La fréquence du syndrome des ovaires polykystiques et les troubles de la fertilité qui en découlent engendrent de nombreuses difficultés de prise en charge en assistance médicale à la procréation. Certains auteurs s’intéressent alors à différents traitements additionnels, protocoles de stimulation ou techniques qui pourraient permettre d’optimiser les cycles de fécondation in vitro. La qualité des ovocytes et des embryons de ces patientes reste également une question en suspens. Elle reste difficile à évaluer de manière pratique au cours de la prise en charge, et aucune des rares études sur ce sujet n’a démontré une réelle infériorité par rapport aux groupes de patientes témoins. De nombreuses différences ont cependant été démontrées par l’étude de facteurs intra- et extra-ovariens. L’avènement de nouvelles techniques génétiques pourrait permettre une meilleure compréhension des mécanismes physiopathologiques du syndrome, mais aussi d’affiner l’évaluation des ovocytes et embryons afin de mieux prédire les résultats des tentatives de fécondation in vitro. Les taux de grossesses et de naissances semblent toutefois comparables à ceux retrouvés dans la population générale.