L'homocystéine est métabolisée selon deux voies : 1) voie de la transsulfuration générant la cystathionine via la cystathionine bêta-synthase (Cbeta S) et son co-facteur, le phosphate de pyridoxal (vitamine B6) ; 2) voie de la reméthylation régénérant de la méthionine via la méthionine synthase et son co-enzyme, la méthylcobalamine, le donneur de méthyl étant le méthyltétrahydrofolate (méthylTHF), lui-même dérivant de la réduction du méthylèneTHF par la méthylènetétrahydrofolate réductase (MTHFR). L'élévation plasmatique de l'homocystéine constitue un facteur de risque d'accidents vasculaires, indépendant des autres facteurs connus ; en effet, l'hyperhomocystéinémie est toxique pour la cellule endothéliale. L'hyperhomocystéinémie est due à des facteurs génétiques : déficit en Cbeta S, en MTHFR, ou "mutants cobalamine", à des facteurs nutritionnels : carences en folates, en vitamine B12 ou en vitamine B6, à certaines pathologies notamment l'insuffisance rénale chronique... Dans les affections congénitales responsables d'hyperhomocystéinémie sévère et d'homocystinurie massive, l'atteinte vasculaire est marquée par une athérosclérose précoce associée à des accidents thromboemboliques artériels et veineux. De nombreuses études épidémiologiques ont montré par ailleurs la relation entre l'hyperhomocystéinémie modérée et la survenue d'accidents vasculaires artériels et veineux dans tous les territoires. L'hyperhomocystéinémie constitue un facteur prédictif de risque d'accidents vasculaires et même de mortalité. Il existe une relation entre, d'une part, la concentration d'homocystéine plasmatique et les concentrations de folates, de vitamine B12, de vitamine B6 et, d'autre part, entre la concentration d'homocystéine plasmatique et une mutation récemment décrite sur le gène de la MTHFR C677 => T, qui, à l'état homozygote, entraîne habituellement une élévation de l'homocystéine plasmatique. L'acide folique diminue, voire normalise, la concentration d'homocystéine plasmatique...