Plusieurs désordres héréditaires affectant les facteurs de la coagulation ont été identifiées comme des facteurs de risque prothrombotiques. La mutation G/A en position 20210 du gène de la prothrombine a été identifiée pour la première fois en 1996. Elle constitue le second polymorphisme important impliqué dans la thrombose veineuse au sein des populations caucasiennes. Elle est présente chez approximativement 5 à 10 % des patients. Les porteurs de ce variant ont des taux plasmatiques élevés de prothrombine, mécanisme le plus probable de l'augmentation du risque de thrombose. Cet allèle est plus couramment retrouvé chez les sous-populations blanches, parmi lesquelles la prévalence des porteurs hétérozygotes varie de 1 à 5 %. Il est beaucoup plus rare chez les Africains ou les Asiatiques. Alors que le rôle de cette mutation procoagulante dans la maladie thrombotique veineuse est bien établi, son implication dans la maladie artérielle n'est pas clair. Toutefois, elle est un facteur de risque important de thrombose artérielle lorsqu'elle est retrouvée en association avec d'autres facteurs classiques du risque artériel. Ce qui conforte l'hypothèse selon laquelle la thrombophilie est une maladie multicausale, avec interaction de facteurs génétiques et acquis.